La máxima autoridad de la Región Scout Interamericana es la Conferencia Scout Interamericana, integrada por representantes de las 32 Organizaciones Scouts Nacionales que pertenecen a ella. La Conferencia se reúne cada 3 años en algún país del continente que, previa postulación de la asociación respectiva, ha sido elegido en la Conferencia inmediatamente anterior.

La Conferencia elige al Comité Scout Interamericano (CSI), que la representa entre sus sesiones y tiene entre sus tareas aprobar e impulsar el Plan Regional de Desarrollo en conformidad a los objetivos, políticas y líneas de acción fijadas por la Conferencia.

También forma parte de los organismos de la Región la Oficina Scout Interamericana (OSI), dependiente de la Oficina Scout Mundial e integrada por un equipo de profesionales que trabajan a tiempo completo en el desarrollo y fortalecimiento del Movimiento Scout en América del Norte, Centroamérica, el Caribe y América del Sur. La OSI es además la Secretaría de la Conferencia y su Director Regional es el Secretario Ejecutivo del CSI.

La Región también cuenta con la Fundación Scout Interamericana (FSI), que tiene como misión recaudar fondos para apoyar y financiar las actividades y proyectos impulsados a nivel regional.

Finalmente, la Región Scout Interamericana ha reconocido como organismo consultivo a la sección americana de la Conferencia Internacional Católica de Escultismo (CICE - América), nexo institucional entre el Movimiento Scout y la Iglesia Católica.